Peptydy z domeną koniczyno-podobną występują głównie w przewodzie pokarmowym. Interakcje tych peptydów z resztami cukrowymi glikoprotein poprzez tworzenie wiązań krzyżowych umożliwiają utrzymywanie prawidłowej architektury śluzu. Odgrywają w ten sposób istotną rolę w tworzeniu bariery chroniącej błonę śluzową. Peptydy z domeną koniczyno-podobną stymulując migrację komórek nabłonka do miejsc uszkodzenia uczestniczą również w regeneracji ubytków powstałych w błonie śluzowej. Związek peptydów z domeną koniczyno-podobną z nowotworami jest nadal niejasny. W przewodzie pokarmowym najprawdopodobniej są one jednym z czynników chroniących przed rozwojem nowotworu. Jednak w raku płacikowym gruczołu sutkowego wysoki poziom tych peptydów wydaje się sprzyjać rozwojowi nowotworu. Możliwe, że wpływając na migrację komórek nowotworowych niektóre peptydy z domeną koniczyno-podobną umożliwiają powstawanie przerzutów i progresję nowotworów.